Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LGALS4P56470 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms