Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GBX2P52951 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms