Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA2P51531 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms