Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms