Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP4P49662 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms