Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms