Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGAEP38570 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms