Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFBP38117 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFBP38117 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFBP38117 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFBP38117 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFBP38117 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETFBP38117 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ETFBP38117 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ETFBP38117 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ETFBP38117 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ETFBP38117 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ETFBP38117 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms