Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZEB1P37275 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms