Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms