Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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HOXD10P28358 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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