Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXP28300 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXP28300 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXP28300 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXP28300 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXP28300 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms