Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms