Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms