Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMY2BP19961 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms