Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms