Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3P10147 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3P10147 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3P10147 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3P10147 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3P10147 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3P10147 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms