Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD3P0DMS9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms