Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR3DP05423 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms