Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOA1P02647 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOA1P02647 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA1P02647 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA1P02647 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms