Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-AP01891 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms