Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX58O95786 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX58O95786 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX58O95786 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms