Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POP4O95707 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POP4O95707 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POP4O95707 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POP4O95707 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POP4O95707 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms