Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNKO75909 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms