Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP5O75197 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP5O75197 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP5O75197 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms