Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NPHP4O75161 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms