Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms