Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRPF3O43395 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPF3O43395 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms