Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPAA1O43292 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPAA1O43292 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms