Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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