Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCAO15360 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCAO15360 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCAO15360 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCAO15360 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCAO15360 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCAO15360 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCAO15360 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCAO15360 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms