Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E2F3O00716 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms