Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms