Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KRW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KRW8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KRW8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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