Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms