Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms