Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms