Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms