Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF879B4DU55 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms