Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms