Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL1A6NKG5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL1A6NKG5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms