Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF316A6NFI3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms