Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMNCA6NCL1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMNCA6NCL1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms