Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRGMA1A4Y4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms