Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A4Q9Y6R1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms