Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms