Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AUP1Q9Y679 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms