Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX8Q9Y5X2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms