Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SNX13Q9Y5W8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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