Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRAP3Q9Y2W1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms